🫀 MICROCARD project

Meshalyzer visualization

🫀 Modélisation numérique de l’atrium humain à très haute résolution

Le défi : La fibrillation atriale est le trouble du rythme cardiaque le plus fréquent — une énigme médicale dont la mécanique intime reste encore difficile à saisir,
rendant les traitements actuels parfois insuffisants sur le long terme.

🎯 Objectifs scientifiques

Développer des modèles numériques de l’atrium à très haute résolution, construits à partir de vraies données patient (CT-scans et IRM) issues de l’IHU-Liryc, afin de :

  • représenter fidèlement les structures clés de l’atrium,
  • simuler la propagation électrique à haute résolution,
  • analyser le rôle des variations anatomiques dans l’initiation et la maintenance de la fibrillation atriale.

🧩 Contributions principales

1. Reconstructions anatomiques haute fidélité

  • Extraction et reconstruction 3D des oreillettes à partir d’imagerie médicale patient.
  • Validation anatomique détaillée via CARPentry Studio :
    • sinus coronaire, veine cave supérieure, faisceau de Bachmann, appendice auriculaire, etc.
  • Vérification, harmonisation et standardisation des labels anatomiques.

2. Construction et optimisation de maillages

  • Ingénierie de maillages à très haute résolution pour simulations éléments finis.
  • Analyse et correction des défauts géométriques (connectivité, surfaces, intersections).
  • Production de modèles “prêts à simuler” compatibles avec la plateforme openCARP.

3. Pipeline de simulation électrophysiologique

  • Préparation des conditions initiales et paramétrages électrophysiologiques.
  • Exécution des simulations sous openCARP et analyse du comportement électrique.
  • Visualisation scientifique et traitement des résultats via Meshalyzer.

📁 Réalisation : Base de données structurée de modèles patient

  • Constitution d’une collection de 30+ modèles auriculaires validés et documentés.
  • Standardisation du pipeline Epsimulator pour assurer traçabilité et reproductibilité.
  • Mise en conformité des modèles avec les besoins du projet MICROCARD (simulation haute-performance, couplage électromécanique, modélisation multiphysique).
mesh p15;

🔬 Compétences mobilisées

Modélisation anatomique Traitement d'images médicales CARPentry Studio Epsimulator openCARP Éléments finis Analyse de données biomédicales
Fakhrielddine Bader
Fakhrielddine Bader
Post-doctoral fellow in Applied Mathematics

Post-doctoral fellow in Applied Mathematics