🫀 MICROCARD project

Meshalyzer visualization

🫀 Modélisation numérique de l’atrium humain à très haute résolution

Le défi : La fibrillation atriale est le trouble du rythme cardiaque le plus fréquent — une énigme médicale dont la mécanique intime reste encore difficile à saisir,
rendant les traitements actuels parfois insuffisants sur le long terme.

🎯 Objectifs scientifiques

Développer des modèles numériques de l’atrium à très haute résolution, construits à partir de vraies données patient (CT-scans et IRM) issues de l’IHU-Liryc, afin de :

  • représenter fidèlement les structures clés de l’atrium,
  • simuler la propagation électrique à haute résolution,
  • analyser le rôle des variations anatomiques dans l’initiation et la maintenance de la fibrillation atriale.

🧩 Contributions principales

1. Reconstructions anatomiques haute fidélité

  • Extraction et reconstruction 3D des oreillettes à partir d’imagerie médicale patient.
  • Validation anatomique détaillée via CARPentry Studio :
    • sinus coronaire, veine cave supérieure, faisceau de Bachmann, appendice auriculaire, etc.
  • Vérification, harmonisation et standardisation des labels anatomiques.

2. Construction et optimisation de maillages

  • Ingénierie de maillages à très haute résolution pour simulations éléments finis.
  • Analyse et correction des défauts géométriques (connectivité, surfaces, intersections).
  • Production de modèles “prêts à simuler” compatibles avec la plateforme openCARP.

3. Pipeline de simulation électrophysiologique

  • Préparation des conditions initiales et paramétrages électrophysiologiques.
  • Exécution des simulations sous openCARP et analyse du comportement électrique.
  • Visualisation scientifique et traitement des résultats via Meshalyzer.

📁 Réalisation : Base de données structurée de modèles patient

  • Constitution d’une collection de 30+ modèles auriculaires validés et documentés.
  • Standardisation du pipeline Epsimulator pour assurer traçabilité et reproductibilité.
  • Mise en conformité des modèles avec les besoins du projet MICROCARD (simulation haute-performance, couplage électromécanique, modélisation multiphysique).
mesh p15;

🔬 Compétences mobilisées

Modélisation anatomique Traitement d'images médicales CARPentry Studio Epsimulator openCARP Éléments finis Analyse de données biomédicales
Fakhrielddine Bader
Fakhrielddine Bader
Postdoctoral Researcher in AI, Modelling and 3D Medical Imaging

Postdoctoral Researcher in AI, Modelling and 3D Medical Imaging